حجت الاسلام والمسلمین سید محمد خاتمی در دیدار با خانواده مرحوم سید محمود دعایی با اشاره به اینکه درگذشت ایشان ضایعه بزرگی بود، گفت: اصلاً باورم نمی شود. این یک تراژدی واقعی بود. خدا رحمت کند. همه ما واقعاً غرق و درمانده هستیم.
رئیس شورای مرکزی مجمع روحانیون مبارز تاکید کرد: بعید است انسان بتواند این غم را فراموش کند. هیچکس جای آقای دعایی را نمی گیرد و همه غصه می خوریم.
وی افزود: شک ندارم که اگر نفس پاک مظهر اعمال است، اکنون آقای دعای تنها در بهشت و در بهترین حالت است. خدا ما را بیامرزد.