مرتضی پورعلیگنجی در حالی که تیم ملی را راهی قطر می کرد، در سه دیدار مرحله گروهی یکی از 11 نفر تیم ملی فوتبال ایران بود.
این در حالی است که گفته می شود قطری ها درخواست های جدی برای جذب شدن توسط پرسپولیس داشته اند اما این درخواست ها به صورت رسمی به باشگاه پرسپولیس ارائه نشده است. در همان زمان برخی از نزدیکان کادر فنی پرسپولیس اعلام کردند که یحیی گل محمدی با جدایی پورعلیگنجی مخالفت کرده است.
در شروع فصل جدید، این مدافع با قراردادی دو ساله به قرمزها پیوست و به نظر می رسد بدون موافقت باشگاه نمی تواند پورالیگانجی را ترک کند.