استعفای علی فتح الله زاده تا امروز حواشی زیادی را به همراه داشت. هر چند این استعفا از سوی اعضای هیئت مدیره پذیرفته نشد اما موجی از نگرانی را برای هواداران استقلال ایجاد کرد.
پرویز مظلومی به عنوان یکی از اعضای هیات مدیره پایتخت آبی پوشان در مصاحبه اخیر خود پاسخی مبهم به این ماجرا داده و گفته است: آقای فتح الله زاده استعفا دادند اما اعضای هیات مدیره خواستار ادامه کار و استعفای ایشان شدند. مخالف بود.
استعفای که شایعات زیادی از جمله نمایشی بودن آن شنیده می شود، حتی نبود گزینه بهتری برای جانشینی در این شرایط سخت باشگاه استقلال اطرافش.